Belajar berdemokrasi sejak usia sekolah menjadi hal penting untuk membentuk karakter siswa yang dapat menghargai perbedaan pendapat sekaligus melatih jiwa kepemimpinan. Ada banyak ragam untuk siswa praktik berdemokrasi, salah satunya melalui kegiatan keorganisasian intra sekolah. Madrasah Aliyah Citra Cendekia memiliki organisasi intrasekolah yang bernama Student Government of Citra Cendekia atau biasa disingkat SGCC sebagai lembaga eksekutif dan Senat sebagai lembaga legislatif.